Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RAB23Q9ULC3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAB23Q9ULC3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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