Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PACSIN3Q9UKS6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN3Q9UKS6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms