Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CROTQ9UKG9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CROTQ9UKG9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms