Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GMEB2Q9UKD1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GMEB2Q9UKD1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms