Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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ZNF180Q9UJW8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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ZNF180Q9UJW8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ZNF180Q9UJW8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ZNF180Q9UJW8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ZNF180Q9UJW8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ZNF180Q9UJW8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ZNF180Q9UJW8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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ZNF180Q9UJW8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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ZNF180Q9UJW8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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ZNF180Q9UJW8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF180Q9UJW8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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