Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSKSQ9UJT2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSKSQ9UJT2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms