Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL4Q9UJQ4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms