Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MBD1Q9UIS9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MBD1Q9UIS9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms