Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RRBP1Q9P2E9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRBP1Q9P2E9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms