Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms