Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms