Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP1Q9NZI2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNIP1Q9NZI2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms