Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ALKBH4Q9NXW9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms