Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PKDREJQ9NTG1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms