Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNTG1Q9NSN8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms