Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FBXO8Q9NRD0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FBXO8Q9NRD0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms