Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
BATF3Q9NR55 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BATF3Q9NR55 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms