Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FZD3Q9NPG1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms