Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BPIFA1Q9NP55 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms