Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TDRD3Q9H7E2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms