Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
REEP4Q9H6H4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms