Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms