Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLIRPQ9GZT3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms