Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BHLHE41Q9C0J9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE41Q9C0J9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms