Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms