Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
THUMPD2Q9BTF0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
THUMPD2Q9BTF0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms