Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BPIFA3Q9BQP9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BPIFA3Q9BQP9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms