Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA1CQ9BQE3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms