Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIN2AQ99865 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms