Protein–RNA interactions for Protein: Q96RG2

PASK, PAS domain-containing serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASKQ96RG2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PASKQ96RG2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PASKQ96RG2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms