Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX18Q96RF0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms