Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TEFMQ96QE5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms