Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM20AQ96MK3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM20AQ96MK3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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FAM20AQ96MK3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM20AQ96MK3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM20AQ96MK3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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FAM20AQ96MK3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM20AQ96MK3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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FAM20AQ96MK3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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FAM20AQ96MK3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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FAM20AQ96MK3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM20AQ96MK3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM20AQ96MK3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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FAM20AQ96MK3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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FAM20AQ96MK3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM20AQ96MK3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM20AQ96MK3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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FAM20AQ96MK3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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FAM20AQ96MK3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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FAM20AQ96MK3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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FAM20AQ96MK3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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FAM20AQ96MK3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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FAM20AQ96MK3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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FAM20AQ96MK3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM20AQ96MK3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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