Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM227BQ96M60 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM227BQ96M60 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms