Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SGCZQ96LD1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms