Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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