Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms