Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NXPE2Q96DL1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NXPE2Q96DL1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms