Protein–RNA interactions for Protein: Q96A23

CPNE4, Copine-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4Q96A23 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CPNE4Q96A23 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms