Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSR2Q969E8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms