Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRAT1Q92837 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms