Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC107Q8WV48 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms