Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX54Q8TDD1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX54Q8TDD1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms