Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMIEQ8NEW7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIEQ8NEW7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms