Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF548Q8NEK5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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