Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
APCDD1LQ8NCL9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms