Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC24Q8N4L8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC24Q8N4L8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms