Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMNTD2Q8IXW0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms