Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP1-3Q8IUG1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRTAP1-3Q8IUG1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms