Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms